高效液相色谱仪的系统由储液器、泵、进样器、色谱柱、检测器、记录仪等几部分组成。储液器中的流动相被高压泵打入系统，样品溶液经进样器进入流动相，被流动相载入色谱柱(固定相)内，由于样品溶液中的各组分在两相中具有不同的分配系数，在两相中做相对运动时，经过反复多次的吸附-解吸的分配过程，各组分在移动速度上产生较大的差别，被分离成单个组分依次从柱内流出，通过检测器时，样品浓度被转换成电信号传送到记录仪，数据以图谱形式打印出来。
高效液相色谱是目前应用最多的色谱分析方法，高效液相色谱系统由流动相储液体瓶、输液泵、进样器、色谱柱、检测器和记录器组成，其整体组成类似于气相色谱，但是针对其流动相为液体的特点作出很多调整。HPLC的输液泵要求输液量恒定平稳;进样系统要求进样便利切换严密;由于液体流动相粘度远远高于气体，为了减低柱压高效液相色谱的色谱柱一般比较粗，长度也远小于气相色谱柱。HPLC应用非常广泛，几乎遍及定量定性分析的各个领域。
高效液相色谱仪的特性：
高压--压力可达150~300kg/cm。色谱柱每米降压为75kg/cm以上。
高速--流速为0.1~10.0mL/min。
高效--塔板数可达5000/米。在一根柱中同时分离成份可达100种。
高灵敏度--紫外检测器灵敏度可达0.01ng。同时消耗样品少。
HPLC与经典液相色谱相比有以下优点:
速度快--通常分析一个样品在15~30min，有些样品甚至在5min内即可完成。
分辨率高--可选择固定相和流动相以达到最佳分离效果。
灵敏度高--紫外检测器可达0.01ng，荧光和电化学检测器可达0.1pg。
色谱柱可反复使用--用一根色谱柱可分离不同的化合物。
样品量少，容易回收--样品经过色谱柱后不被破坏，可以收集单一组分或做制备。
